Alphaproteobacteria

Alphaproteobacteria
Datei:Agrobacterium-tumefaciens.png Agrobacterium tumefaciens (Rhizobiales) an einer Möhrenzelle (sekundärelektronenmikroskopisches Bild)
Systematik
Domäne: Bakterien (Bacteria) Reich: Pseudomonadati Abteilung: Proteobakterien (Pseudomonadota) Klasse: Alphaproteobacteria
Wissenschaftlicher Name
Alphaproteobacteria
Garrity et al. 2006

Alphaproteobacteria (auch α-Proteobacteria) bezeichnet eine Klasse im phylogenetischen System der Bakterien, das auf der Grundlage der Basensequenz der ribosomalen 16S-Ribonukleinsäure (16S-rRNA) aufgestellt wurde. Sie gehören zum Stamm (Phylum) der Proteobacteria.

Systematik

Zu den Alphaproteobacteria gehören die Ordnungen<ref>J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) - [1] (Stand: 17. Februar Januar 2023)</ref>

• Caulobacterales Henrici & Johnson 1935
• Emcibacterales Iino et al. 2016
• Holosporales Szokoli et al. 2020
• Hyphomicrobiales Douglas 1957
• Iodidimonadales Iino et al. 2016
• Kordiimonadales Kwon et al. 2005
• Magnetococcales Bazylinski et al. 2013
• Mariprofundales Hördt et al. 2020
• Micropepsales Harbison et al. 2017
• Minwuiales Sun et al. 2018
• Rhodobacterales Garrity et al. 2006
• Rhodospirillales Pfennig and Trüper 1971
• Rhodothalassiales Venkata Ramana et al. 2014
• Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939
• Sneathiellales Kurahashi et al. 2008
• Sphingomonadales Yabuuchi and Kosako 2006

Wichtige Vertreter sind unter anderem in den Gattungen Rhodospirillum, Acetobacter, Rickettsia, Paracoccus, Zymomonas, Rhizobium, Bartonella, Brucella und Nitrobacter zu finden. Unter den Alphaproteobakterien kommen zahlreiche aquatisch lebende Arten vor. Hohe Anteile dieser Bakterien in Gewässerproben zeigen oft oligotrophe Verhältnisse an.

Stammbaum der Alphaproteobacteria auf Basis ribosomaler RNA (rRNA)
Magnetococcidae  Magnetococcus marinus      Caulobacteridae  Caulobacterales, Rhodospirillales, Sphingomonadales, Rhodobacteraceae, Rhizobiales etc.     Holosporales  Rickettsidae   Pelagibacterales  Untergruppen Ia (Pelagibacteraceae, mit Pelagibacter), Ib, II, IIIa, IIIb, IV und V     Proto-Mitochondrien      Anaplasmataceae  Ehrlichia     Anaplasma     Wolbachia     Neorickettsia      Midichloriaceae  Midichloria  Rickettsiaceae  Rickettsia     Orientia Vorlage:Klade/Wartung/Style
Kladogramm auf Basis des Vergleichs der 16S- und 23S-rRNA-Sequenzen. Ferla et al.<ref name="Ferla2013">Vorlage:Cite book/URLVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung2</ref>

Die Rickettsiales werden dabei als ein Taxon verstanden, das die Anaplasmataceae, Rickettsiaceae und Midichloriaceae umfasst. Werden die Proto-Mitochondrien ebenfalls mit einbezogen, dann erscheinen im obigen Kladogramm die Rickettsiales als Schwestergruppe der Pelagibacterales (wären also der Zweig unterhalb dieser); vielleicht stellen letztere aber auch eine basale Untergruppe der Rickettsiales dar. Details zu den Caulobacteridae siehe Parvularcula bermudensis. Weitere hier nicht aufgeführte Taxa der Alphaproteobacteria sind (wo nicht eigens vermerkt gemäß List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)<ref name="Euzeby">Vorlage:Cite book/NameVorlage:Cite book/Name: [ Alphaproteobacteria.] List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), , archiviert vom Vorlage:IconExternal (nicht mehr online verfügbar) am Vorlage:Cite book/URL; abgerufen am 26. April 2019 (). Vorlage:Cite book/URLVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung2Vorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung</ref> und National Center for Biotechnology Information (NCBI)<ref>Vorlage:Cite book/NameVorlage:Cite book/Name: [ Alphaproteobacteria.] [National Center for Biotechnology Information] (NCBI) taxonomy database, , archiviert vom Vorlage:IconExternal (nicht mehr online verfügbar) am Vorlage:Cite book/URL; abgerufen am 26. April 2019 (). Vorlage:Cite book/URLVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung2Vorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung</ref> sowie der 16S-rRNA-basierten Phylogenie nach Release 106 des Projekts „The All-Species Living Tree“<ref name="LTPs106_SSU_tree">Vorlage:Cite book/Name: [ 16S rRNA-based LTP release 106 (full tree).] Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database, , archiviert vom Vorlage:IconExternal (nicht mehr online verfügbar) am Vorlage:Cite book/URL; abgerufen am 23. März 2024. Vorlage:Cite book/URLVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung2Vorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/MeldungVorlage:Cite book/Meldung</ref>) unter anderem:

• Sneathiellales mit Sneathiella chinensis, S. chungangensis, S. glossodoripedis (basal in Rickettsiales<ref>Sneathiella, auf: LPSN</ref><ref>Sneathiella glossodoripedis, auf: UniProt</ref> oder zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013))
• Parvularculales mit Parvularcula bermudensis (nahe Rhodobacterales/Rhizobiales, Caulobacteridae)<ref name="PMID12892122">Jang-Cheon Cho, Stephen J. Giovannoni: Parvularcula bermudensis gen. nov., sp. nov., a marine bacterium that forms a deep branch in the α-Proteobacteria. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology Band 53, Nr. 4, Juli 2003, S. 1031–1036, ISSN 1466-5026. doi:10.1099/ijs.0.02566-0. PMID 12892122.</ref>
• Iodidimonadales mit Iodidimonas muriae<ref>Genus Iodidimonas, auf LPSN</ref> zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
• Kiloniellales mit Kiloniella laminarae zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
• Kordiimonadales mit Kordiimonas gwangyangensis<ref>Order Kordiimonadales, auf LPSN</ref> zu den Caulobacteridae (Ferla et al. 2013)
• Micropepsales mit Micropepsis pineolensis (incerta sedis)<ref>Order Micropepsales, auf LPSN</ref>
• Rhodovibrio mit Rhodovibrio salinarum, R. sodomensis (Rhodospirillaceae, Caulobacteridae)<ref>Rhodovibrio salinarum, auf: BacDive</ref>
• Micavibrio aeruginosavorus Kwon et al. 2005 (incerta sedis)
• Vibrio adaptatus und V. cyclosites (nach Muir et al. 1990 nicht Gattung Vibrio, sondern bisher nicht bezeichnete Gattung(en) der Alphaproteobacteria, incerta sedis)
• Furvibacter Lee et al. 2007
• Polymorphum gilvum Cai 2010
• Subaequorebacter tamlense Lee 2006<ref>Subaequorebacter, auf: NCBI Taxonomy Browser</ref>
• Tuberoidobacter mutans Nikitin 1983<ref>Advances in Microbial Physiology, Vol. 24, Academic Press, 12. Juli 1983, ISBN 0-12-027724-7, S. 111</ref><ref>Tuberoidobacter, on: IniProt Taxonomy</ref><ref>Tuberoidobacter, auf: NCBI Taxonomy Browser</ref>

Quellen

<references />

Literatur

• Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt (Hrsg.) The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria. 7 Bände, 3. Auflage, Springer-Verlag, New York u. a. O., 2006, ISBN 0-387-30740-0. Vol. 5: Proteobacteria: Alpha and Beta Subclass ISBN 0-387-30745-1

Weblinks

Commons: Alphaproteobacteria – Sammlung von Bildern und Videos

• Tree of Life Web Project - alpha Proteobacteria
• Bacterial (Prokaryotic) Phylogeny Webpage: Phylogeny and Protein Signatures for Alpha Proteobacteria.